ストーリー

ソラたちの冒険の記録を綴ったジミニーメモ。

1つめの旅の後、XIII機関の企みにより「忘却の城」で記憶をバラバラにされたソラたちは、 解かれた記憶をつなぎ直すため、1年間の眠りにつく。

そして目覚めたとき、ジミニーメモに残ったのは「ナミネにお礼をいう」というメッセージのみ。 記憶を取り戻したソラたちは、2つめの旅にでる。

そして2つめの旅が終わり、世界が平和を取り戻したころ、 1冊目のジミニーメモに書いた覚えのない、謎のメッセージが記されていた。

「彼らの痛みを癒しに戻らなければならない」

メッセージに疑問をもった王様は、ジミニーメモをデータ化し、調査しようとするが、 データの世界は原因不明のバグに浸食されていた。

データ世界に散らばったバグを取り除き、メモの謎を解明できるのは一人しかいない------

真相を探るため、データ世界のソラの、新たな冒険が始まる。