見た目は子供だが、その正体は日本警察の救世主とも
言われた高校生名探偵・工藤新一。
幼なじみで同級生の蘭と遊園地でデートしている最中に、
謎の黒ずくめの男達に毒薬を飲まされ、
小学生の体になってしまった。
その日以来、正体を隠すため、仮の名・江戸川コナンを名乗り、
幼なじみの毛利蘭の家に居候しながら、
数々の事件を解き明かす日々を送っている。
すべては自分の体を取り戻すため。

シャーロック・ホームズにあこがれる高校生探偵。
5月4日生まれの17歳。帝丹高校2年B組。
高校1年生の時、L.Aにいく飛行機内での殺人事件を解決。
そこで目暮警部達と知り合い、
以来、高校生探偵として活躍するように。
特技はサッカーで、リフティングをすると頭が冴える。
幼なじみの蘭と行った遊園地で、
黒ずくめの男達の取引現場に遭遇し、
組織が開発中の毒薬を飲まされて以来、消息を絶っている。

新一の幼なじみであり、帝丹高校2年B組に通い、
空手部の女主将で都大会でもナンバーワンの実力を誇る
文武両道の女子高生。新一のことがずっと好きで、
突然いなくなってしまった彼の帰りを待っている。
時にはコナンの名推理に、新一の面影を重ねることもあるが、
コナンを始め、少年探偵団のことを母親のように
優しく面倒見ている。
また、幼なじみの鈴木園子とは親友で、
昔からいろんなことを話し合う仲。

蘭の父で、警視庁捜査一課の元刑事であるため、
目暮警部とは古くからの付き合いがある。
現在は探偵事務所を開業していて、
コナンの名推理のおかげで、「眠りの小五郎」として
有名となっている。別居中の妻・妃英理とは、
蘭の必死の努力でたびたび顔を合わせることとなるが、
女好きの一面が邪魔をし、素直に復縁へ向かうことは難しい。

新一の隣の家に住む風変わりな発明家で、
コナンの正体を知る数少ない人物の1人。
蝶ネクタイ型変声機やキック力増強シューズ、
探偵バッジやボール射出ベルトなど、
数々の探偵グッズを発明してくれた良き理解者で、
少年探偵団の面倒も見る。
灰原哀が組織を脱出してきた直後から、彼女を保護している。

見た目は子供だが、実は黒ずくめの組織で、
新一が飲まされた薬を開発していた研究者で、
コードネームはシェリー。姉を殺され、組織を裏切ったのだが、
脱出するために、薬を飲んで、小学生の姿に。
現在は阿笠博士にかくまってもらい、
コナンと一緒に帝丹小学校1年B組に通いながら、
解毒剤の研究をしている。
この世でたったひとり、コナンが同じ境遇を分かち合える相手。

少年探偵団のアイドル的存在。
自称「キュートな女探偵」で、好奇心旺盛だが泣き虫でもある。
また、コナンのことが大好きで、灰原が転校してきた当初は、
「コナン君のこと、好きなの?」とやきもちを妬くこともあったが、
今では少年探偵団の女子メンバーとして、
チームワークを発揮している。

真面目な頭脳派で、時にはコナンのピンチを救うことも…?
また、協調性があり、紳士的なので、
歩美ちゃんや灰原のことを守ったりもする。

自称、少年探偵団のリーダー。
しょっちゅう言い間違いをするが、正義感の強さはピカイチである。
大食らいで力持ちの食いしん坊でもあり、うな重が大の好物。

蘭の同級生で大親友。工藤新一とも同級生。
鈴木財閥のお嬢様でとにかく流行ものとブランド物が好き。
好奇心が強く、小五郎と張り合うくらい調子がいいので、
まったくお嬢様っぽく見えない。
京極真とは恋人関係にある。

毛利小五郎の妻で、蘭の母でもあるが、
訳あって10年前から別居中。
推理力、判断力とも申し分ない女性弁護士。
「法曹界のクィーン」の異名をもつ。
独特の怖さでコナンをビビらせながらも、
コナンの観察力、推理力、知識量に正当な評価を下す。
真実を見抜く目をもち、信念を曲げず、情に流されない。

新一の父。
世界的に有名な推理小説家で、
新一以上の頭脳と推理力をもつ唯一の人物。
新一は、いままで一度も優作に推理で優ったことがない。
頭脳明晰だが、新一もビビるほどのイタズラ好き。
現在は妻・有希子とともにアメリカに住んでいる。

新一の母・昔は人気女優だったが、
優作との結婚とともに引退した。
1人で黒ずくめの男達に立ち向かう新一を心配しながらも、
たまに帰国して新一の前に現れる楽天家ぶりが、
コナンを支えている。